Views: 23212|回复 Reply: 15
[综合交流]
配位化学中的“硬亲硬,软亲软”如何从量子化学角度理解?
[复制链接 Copy URL]
lastzealot
lastzealot
当前离线
UID469
在线时间285 小时
注册时间2014-11-29
最后登录2021-5-28
好友6
720
帖子0
威望1252
eV
Level 5 (御坂), 积分 credits 1972, 距离下一级还需 2028 积分 credits
积分1972
Level 5 (御坂)
发消息 Send PM
电梯直达 Go to
楼主
发表于 Post on 2015-8-18 10:01:24
|
只看该作者 Only view this author
|倒序浏览 Reverse view
|阅读模式 Reading model
如题
感谢老师
收藏 Add to favorites8
回复 Reply
举报 Report
sobereva
sobereva
当前离线
UID1
在线时间6122 小时
注册时间2014-10-7
最后登录2026-6-11
好友67
6万
帖子99
威望6万
eV
积分127412
管理员
公社社长
发消息 Send PM
2#
发表于 Post on 2015-8-18 14:03:37
|
只看该作者 Only view this author
量化里的硬度就是(IP-EA)/2,近似等于gap,软度就是其倒数。软度越大,电子越容易被极化。
软酸和软碱、硬酸和硬碱结合,算出来的对应的自由能下降应该较多,相应地结合常数较大。
北京科音自然科学研究中心(http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班、中级量子化学培训班、高级量子化学培训班、量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班、分子动力学与GROMACS培训班、CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》。
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
回复 Reply
举报 Report
lastzealot
lastzealot
当前离线
UID469
在线时间285 小时
注册时间2014-11-29
最后登录2021-5-28
好友6
720
帖子0
威望1252
eV
Level 5 (御坂), 积分 credits 1972, 距离下一级还需 2028 积分 credits
积分1972
Level 5 (御坂)
发消息 Send PM
3#
楼主 Author|
发表于 Post on 2015-8-18 17:33:58
|
只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-8-18 14:03
量化里的硬度就是(IP-EA)/2,近似等于gap,软度就是其倒数。软度越大,电子越容易被极化。
软酸和软碱、硬 ...
非常感谢sob老师的指导,小弟还有几个问题想咨询下
1. 请问这个具体的关键词是什么?是不是分别算出酸、碱、络合物的软度或硬度?然后下一步应该如何做呢?
2. 请问自由能的变化是不是加入freq关键词后得到的free energy得到的?
3. 结合常数怎么计算?
再次感谢sob老师
回复 Reply
举报 Report
youyno
youyno
当前离线
UID213
在线时间836 小时
注册时间2014-10-26
最后登录2026-5-31
好友9
219
帖子3
威望4821
eV
积分5100
Level 6 (一方通行)
发消息 Send PM
4#
发表于 Post on 2015-8-18 19:47:31
|
只看该作者 Only view this author
IP是电离能, EA是电子亲和能,IP也就是分子A变为A+的所需要的能量,EA为A变为A-所放出的能量。
Monte Carlo
回复 Reply
举报 Report
sobereva
sobereva
当前离线
UID1
在线时间6122 小时
注册时间2014-10-7
最后登录2026-6-11
好友67
6万
帖子99
威望6万
eV
积分127412
管理员
公社社长
发消息 Send PM
5#
发表于 Post on 2015-8-18 19:57:06
|
只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2015-8-18 17:33
非常感谢sob老师的指导,小弟还有几个问题想咨询下
1. 请问这个具体的关键词是什么?是不是分别算出酸、 ...
1 没有具体关键词。自行算不同态的单点,然后求差。见此贴http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=1423
2 是,但是当然你得求差值得到deltaG
3 deltaG=-RTLnK
算一批酸,一批碱,然后看K是否符合HSAB关系。
北京科音自然科学研究中心(http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班、中级量子化学培训班、高级量子化学培训班、量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班、分子动力学与GROMACS培训班、CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》。
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
回复 Reply
举报 Report
liyuanhe211
liyuanhe211
当前离线
UID1526
在线时间3246 小时
注册时间2015-7-20
最后登录2025-10-22
好友29
3097
帖子29
威望1万
eV
积分17272
Level 6 (一方通行)
发消息 Send PM
6#
发表于 Post on 2015-8-18 20:41:08
|
只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2015-8-18 17:33
非常感谢sob老师的指导,小弟还有几个问题想咨询下
1. 请问这个具体的关键词是什么?是不是分别算出酸、 ...
这种十分不靠谱的定性理论,我感觉拿HF看一下HOMO和LUMO的能量就差不多了(Koopman theorem)
回复 Reply
举报 Report
lastzealot
lastzealot
当前离线
UID469
在线时间285 小时
注册时间2014-11-29
最后登录2021-5-28
好友6
720
帖子0
威望1252
eV
Level 5 (御坂), 积分 credits 1972, 距离下一级还需 2028 积分 credits
积分1972
Level 5 (御坂)
发消息 Send PM
7#
楼主 Author|
发表于 Post on 2015-8-18 23:26:27
|
只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-8-18 19:57
1 没有具体关键词。自行算不同态的单点,然后求差。见此贴http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthr ...
谢谢sob老师
我计算的deltaG和实验值相差很多,估计得到的K也没啥意义了。
回复 Reply
举报 Report
lastzealot
lastzealot
当前离线
UID469
在线时间285 小时
注册时间2014-11-29
最后登录2021-5-28
好友6
720
帖子0
威望1252
eV
Level 5 (御坂), 积分 credits 1972, 距离下一级还需 2028 积分 credits
积分1972
Level 5 (御坂)
发消息 Send PM
8#
楼主 Author|
发表于 Post on 2015-8-18 23:28:44
|
只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2015-8-18 20:41
这种十分不靠谱的定性理论,我感觉拿HF看一下HOMO和LUMO的能量就差不多了(Koopman theorem)
首先谢谢你
你所说的计算HOMO/LUMO能量差是不是指计算金属离子(电子受体)的LUMO能量和配体(电子给体)的HOMO能量,然后LUMO-HOMO得到能量差?
是这个意思吗
回复 Reply
举报 Report
sobereva
sobereva
当前离线
UID1
在线时间6122 小时
注册时间2014-10-7
最后登录2026-6-11
好友67
6万
帖子99
威望6万
eV
积分127412
管理员
公社社长
发消息 Send PM
9#
发表于 Post on 2015-8-19 00:20:16
|
只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2015-8-18 23:26
谢谢sob老师
我计算的deltaG和实验值相差很多,估计得到的K也没啥意义了。
别忘了要把溶剂化自由能考虑进去,影响很大
另外计算级别的选择、计算流程要合适,比如频率校正因子的考虑
北京科音自然科学研究中心(http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班、中级量子化学培训班、高级量子化学培训班、量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班、分子动力学与GROMACS培训班、CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》。
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
回复 Reply
举报 Report
lastzealot
lastzealot
当前离线
UID469
在线时间285 小时
注册时间2014-11-29
最后登录2021-5-28
好友6
720
帖子0
威望1252
eV
Level 5 (御坂), 积分 credits 1972, 距离下一级还需 2028 积分 credits
积分1972
Level 5 (御坂)
发消息 Send PM
10#
楼主 Author|
发表于 Post on 2015-8-19 08:08:42
|
只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-8-19 00:20
别忘了要把溶剂化自由能考虑进去,影响很大
另外计算级别的选择、计算流程要合适,比如频率校正因子的 ...
我用的是smd的水溶剂,您说的计算流程是啥意思?我就是用freq关键词计算的,理论水平是b3lyp/6-311g**,应该还算是精度比较高。
那个频率校正因子是啥?怎么用呢?
谢谢老师
回复 Reply
举报 Report
sobereva
sobereva
当前离线
UID1
在线时间6122 小时
注册时间2014-10-7
最后登录2026-6-11
好友67
6万
帖子99
威望6万
eV
积分127412
管理员
公社社长
发消息 Send PM
11#
发表于 Post on 2015-8-19 12:07:19
|
只看该作者 Only view this author
谈谈谐振频率校正因子
http://sobereva.com/221
你用的级别精度称不上高。
M062X/TZVP结果会比这个明显更好。
要在气相下算完自由能后再加上溶解自由能才是合理的水中的自由能。
北京科音自然科学研究中心(http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班、中级量子化学培训班、高级量子化学培训班、量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班、分子动力学与GROMACS培训班、CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》。
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
回复 Reply
举报 Report
虎王
虎王
当前离线
UID616
在线时间354 小时
注册时间2014-12-30
最后登录2026-3-25
好友3
294
帖子2
威望3054
eV
Level 5 (御坂), 积分 credits 3388, 距离下一级还需 612 积分 credits
积分3388
Level 5 (御坂)
发消息 Send PM
12#
发表于 Post on 2015-8-19 16:34:18
|
只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-8-18 14:03
量化里的硬度就是(IP-EA)/2,近似等于gap,软度就是其倒数。软度越大,电子越容易被极化。
软酸和软碱、硬 ...
请问数值上,IP为正数,PA为负数吗?那IP-EA是否就等于绝对值相加?
回复 Reply
举报 Report
sobereva
sobereva
当前离线
UID1
在线时间6122 小时
注册时间2014-10-7
最后登录2026-6-11
好友67
6万
帖子99
威望6万
eV
积分127412
管理员
公社社长
发消息 Send PM
13#
发表于 Post on 2015-8-19 17:17:27
|
只看该作者 Only view this author
虎王 发表于 2015-8-19 16:34
请问数值上,IP为正数,PA为负数吗?那IP-EA是否就等于绝对值相加?
IP都是为正的。EA可正可负,为正的时候就是有能力再接受一个电子的体系。
IP-EA就是代数运算,不取绝对值。
北京科音自然科学研究中心(http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班、中级量子化学培训班、高级量子化学培训班、量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班、分子动力学与GROMACS培训班、CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》。
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
回复 Reply
举报 Report
Stefinetaipei
Stefinetaipei
当前离线
UID17978
在线时间30 小时
注册时间2020-2-11
最后登录2020-6-9
好友0
14
帖子0
威望79
eV
Level 2 能力者, 积分 credits 93, 距离下一级还需 57 积分 credits
积分93
Level 2 能力者
发消息 Send PM
14#
发表于 Post on 2020-5-18 09:17:39
|
只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-8-18 19:57
1 没有具体关键词。自行算不同态的单点,然后求差。见此贴http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthr ...
SOB老师您好,关于这里的(2,3)点我想问一下
这里的 deltaG 是单纯指 Freq里面的 吉布斯热矫正量 做差 还是说 吉布斯的热校正量+精算后单点能 的总能做差?
我看了您关于隐式溶剂模型下关于自由能的计算那篇文章,更应该使用后者是吗?
回复 Reply
举报 Report
sobereva
sobereva
当前离线
UID1
在线时间6122 小时
注册时间2014-10-7
最后登录2026-6-11
好友67
6万
帖子99
威望6万
eV
积分127412
管理员
公社社长
发消息 Send PM
15#
发表于 Post on 2020-5-18 23:39:51
|
只看该作者 Only view this author
Stefinetaipei 发表于 2020-5-18 09:17
SOB老师您好,关于这里的(2,3)点我想问一下
这里的 deltaG 是单纯指 Freq里面的 吉布斯热矫正量 做差 ...
显然是后者。前者太糙
北京科音自然科学研究中心(http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班、中级量子化学培训班、高级量子化学培训班、量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班、分子动力学与GROMACS培训班、CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》。
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
回复 Reply
举报 Report